MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter marburgensis str. Marburg chromosome

Total Repeats: 29181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014408	TGA	2	6	112	117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313779
2	NC_014408	A	6	6	149	154	100 %	0 %	0 %	0 %	304313779
3	NC_014408	GGA	2	6	196	201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313779
4	NC_014408	CAC	2	6	252	257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313779
5	NC_014408	AT	3	6	269	274	50 %	50 %	0 %	0 %	304313779
6	NC_014408	ACAGGG	2	12	281	292	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	304313779
7	NC_014408	AGG	2	6	330	335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313779
8	NC_014408	ACA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304313779
9	NC_014408	CAG	2	6	425	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313779
10	NC_014408	TTG	2	6	534	539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304313779
11	NC_014408	ATG	2	6	570	575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313779
12	NC_014408	GAG	2	6	673	678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313779
13	NC_014408	TTG	2	6	729	734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304313779
14	NC_014408	AGG	2	6	768	773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313779
15	NC_014408	TGA	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313779
16	NC_014408	GCA	2	6	806	811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313779
17	NC_014408	AGG	3	9	822	830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313779
18	NC_014408	CAG	2	6	864	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313779
19	NC_014408	CAA	2	6	946	951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304313779
20	NC_014408	CAT	2	6	961	966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313779
21	NC_014408	CAGC	2	8	979	986	25 %	0 %	25 %	50 %	304313779
22	NC_014408	AGG	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313779
23	NC_014408	AGA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304313779
24	NC_014408	CAAC	2	8	1149	1156	50 %	0 %	0 %	50 %	304313779
25	NC_014408	AGGGGA	2	12	1166	1177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313779
26	NC_014408	GGA	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313779
27	NC_014408	AAG	2	6	1271	1276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304313780
28	NC_014408	GCCT	2	8	1305	1312	0 %	25 %	25 %	50 %	304313780
29	NC_014408	CAT	2	6	1504	1509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313780
30	NC_014408	CAT	2	6	1516	1521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313780
31	NC_014408	G	6	6	1598	1603	0 %	0 %	100 %	0 %	304313780
32	NC_014408	AGTG	2	8	1650	1657	25 %	25 %	50 %	0 %	304313780
33	NC_014408	AGG	2	6	1746	1751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313780
34	NC_014408	TGGG	2	8	1755	1762	0 %	25 %	75 %	0 %	304313780
35	NC_014408	CAT	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313780
36	NC_014408	TTG	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304313780
37	NC_014408	CAT	2	6	2018	2023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313780
38	NC_014408	ATC	2	6	2114	2119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313780
39	NC_014408	TG	3	6	2198	2203	0 %	50 %	50 %	0 %	304313781
40	NC_014408	CCT	2	6	2237	2242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313781
41	NC_014408	ATT	2	6	2262	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304313781
42	NC_014408	CTC	2	6	2362	2367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313781
43	NC_014408	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304313781
44	NC_014408	TCC	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313781
45	NC_014408	AGGTCA	2	12	2430	2441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	304313781
46	NC_014408	CCT	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313781
47	NC_014408	T	6	6	2472	2477	0 %	100 %	0 %	0 %	304313781
48	NC_014408	CACC	2	8	2572	2579	25 %	0 %	0 %	75 %	304313781
49	NC_014408	CAA	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304313781
50	NC_014408	ATC	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313781
51	NC_014408	CCT	2	6	2702	2707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313781
52	NC_014408	CCT	2	6	2797	2802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313781
53	NC_014408	ATC	2	6	2805	2810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313781
54	NC_014408	GAT	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313781
55	NC_014408	TCC	2	6	2844	2849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313781
56	NC_014408	AGG	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313781
57	NC_014408	T	6	6	2915	2920	0 %	100 %	0 %	0 %	304313782
58	NC_014408	GCT	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304313782
59	NC_014408	TGTC	2	8	3134	3141	0 %	50 %	25 %	25 %	304313782
60	NC_014408	TCCC	2	8	3162	3169	0 %	25 %	0 %	75 %	304313782
61	NC_014408	TCC	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313782
62	NC_014408	TAT	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304313782
63	NC_014408	CCA	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313782
64	NC_014408	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304313782
65	NC_014408	TTTC	2	8	3421	3428	0 %	75 %	0 %	25 %	304313782
66	NC_014408	AG	3	6	3465	3470	50 %	0 %	50 %	0 %	304313782
67	NC_014408	C	7	7	3613	3619	0 %	0 %	0 %	100 %	304313782
68	NC_014408	T	6	6	3638	3643	0 %	100 %	0 %	0 %	304313782
69	NC_014408	TAG	2	6	3664	3669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313782
70	NC_014408	ACC	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313782
71	NC_014408	TTC	2	6	3707	3712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313782
72	NC_014408	TCT	3	9	3717	3725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313782
73	NC_014408	CTC	2	6	3739	3744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313782
74	NC_014408	ATC	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313782
75	NC_014408	CTC	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313782
76	NC_014408	TAT	2	6	4014	4019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304313782
77	NC_014408	TTC	2	6	4171	4176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313782
78	NC_014408	TGGA	2	8	4206	4213	25 %	25 %	50 %	0 %	304313782
79	NC_014408	GCT	2	6	4261	4266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304313782
80	NC_014408	TGA	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313782
81	NC_014408	GC	3	6	4311	4316	0 %	0 %	50 %	50 %	304313782
82	NC_014408	AGG	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313782
83	NC_014408	CTT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313782
84	NC_014408	AGG	2	6	4432	4437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313782
85	NC_014408	ACC	2	6	4540	4545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313782
86	NC_014408	TGAG	2	8	4838	4845	25 %	25 %	50 %	0 %	304313782
87	NC_014408	GAG	2	6	4857	4862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313782
88	NC_014408	CTC	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313782
89	NC_014408	TC	3	6	4950	4955	0 %	50 %	0 %	50 %	304313782
90	NC_014408	CCA	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313782
91	NC_014408	CAA	2	6	4973	4978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304313782
92	NC_014408	CCTT	2	8	5021	5028	0 %	50 %	0 %	50 %	304313782
93	NC_014408	CTG	2	6	5036	5041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304313782
94	NC_014408	CTG	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304313782
95	NC_014408	CCG	2	6	5289	5294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304313783
96	NC_014408	CAC	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313783
97	NC_014408	AGC	2	6	5642	5647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313784
98	NC_014408	TCT	2	6	5679	5684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313784
99	NC_014408	CCT	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313784
100	NC_014408	TGC	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304313784
101	NC_014408	CCT	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313784
102	NC_014408	CCAT	2	8	5826	5833	25 %	25 %	0 %	50 %	304313784
103	NC_014408	AAC	2	6	5933	5938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304313784
104	NC_014408	T	6	6	5977	5982	0 %	100 %	0 %	0 %	304313784
105	NC_014408	T	6	6	5986	5991	0 %	100 %	0 %	0 %	304313784
106	NC_014408	TTTATT	2	12	6087	6098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304313784
107	NC_014408	TGA	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313784
108	NC_014408	TC	3	6	6187	6192	0 %	50 %	0 %	50 %	304313784
109	NC_014408	ACC	2	6	6207	6212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313784
110	NC_014408	T	6	6	6227	6232	0 %	100 %	0 %	0 %	304313784
111	NC_014408	AAT	2	6	6238	6243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304313784
112	NC_014408	TTC	2	6	6321	6326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313784
113	NC_014408	TGT	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304313784
114	NC_014408	CT	3	6	6534	6539	0 %	50 %	0 %	50 %	304313785
115	NC_014408	GCA	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313785
116	NC_014408	AGT	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313785
117	NC_014408	CTCAGT	2	12	6632	6643	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	304313785
118	NC_014408	ATA	2	6	6721	6726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304313785
119	NC_014408	TTC	2	6	6727	6732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313785
120	NC_014408	GGC	3	9	6850	6858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304313785
121	NC_014408	CTG	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304313785
122	NC_014408	CCT	2	6	6918	6923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313785
123	NC_014408	CCT	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313785
124	NC_014408	T	6	6	6945	6950	0 %	100 %	0 %	0 %	304313785
125	NC_014408	TCC	2	6	6974	6979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313785
126	NC_014408	GATAA	2	10	7252	7261	60 %	20 %	20 %	0 %	304313786
127	NC_014408	GCA	2	6	7277	7282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313786
128	NC_014408	TGG	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304313786
129	NC_014408	CAA	2	6	7370	7375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304313786
130	NC_014408	GAC	2	6	7408	7413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313786
131	NC_014408	GAAA	2	8	7486	7493	75 %	0 %	25 %	0 %	304313786
132	NC_014408	AC	3	6	7529	7534	50 %	0 %	0 %	50 %	304313786
133	NC_014408	CTT	2	6	7627	7632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313786
134	NC_014408	ATGC	2	8	7642	7649	25 %	25 %	25 %	25 %	304313786
135	NC_014408	TCA	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313786
136	NC_014408	TCC	2	6	7793	7798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313786
137	NC_014408	TCACAA	2	12	7799	7810	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	304313786
138	NC_014408	CAT	2	6	7820	7825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313786
139	NC_014408	GGA	2	6	7836	7841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313786
140	NC_014408	GGA	2	6	7860	7865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304313786
141	NC_014408	GA	3	6	7908	7913	50 %	0 %	50 %	0 %	304313786
142	NC_014408	ACC	2	6	7940	7945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313786
143	NC_014408	GAA	2	6	7963	7968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304313786
144	NC_014408	ATT	2	6	7973	7978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304313786
145	NC_014408	G	6	6	8075	8080	0 %	0 %	100 %	0 %	304313786
146	NC_014408	ATC	2	6	8112	8117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313786
147	NC_014408	AACTCA	2	12	8354	8365	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	304313786
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149	NC_014408	CAG	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313786
150	NC_014408	AT	4	8	8461	8468	50 %	50 %	0 %	0 %	304313786
151	NC_014408	ATA	2	6	8519	8524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304313786
152	NC_014408	AAT	2	6	8565	8570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304313786
153	NC_014408	TCA	2	6	8737	8742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313787
154	NC_014408	TCC	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313787
155	NC_014408	TAC	2	6	8859	8864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313787
156	NC_014408	C	6	6	8868	8873	0 %	0 %	0 %	100 %	304313787
157	NC_014408	GCA	2	6	8911	8916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313787
158	NC_014408	GGC	2	6	8925	8930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304313787
159	NC_014408	CTT	2	6	8964	8969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313787
160	NC_014408	CTT	2	6	8989	8994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313787
161	NC_014408	TCA	2	6	8998	9003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313787
162	NC_014408	GGT	2	6	9051	9056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304313787
163	NC_014408	CCT	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313787
164	NC_014408	TGA	2	6	9183	9188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313787
165	NC_014408	GGC	2	6	9195	9200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304313787
166	NC_014408	TCC	2	6	9272	9277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313787
167	NC_014408	TCA	2	6	9358	9363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313787
168	NC_014408	GGT	2	6	9365	9370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304313787
169	NC_014408	GCCC	2	8	9419	9426	0 %	0 %	25 %	75 %	304313787
170	NC_014408	TGTT	2	8	9431	9438	0 %	75 %	25 %	0 %	304313787
171	NC_014408	GTGCAG	2	12	9535	9546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	304313787
172	NC_014408	TGA	2	6	9564	9569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313787
173	NC_014408	TC	3	6	9633	9638	0 %	50 %	0 %	50 %	304313787
174	NC_014408	GACCCT	2	12	9672	9683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	304313787
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177	NC_014408	TCC	2	6	9703	9708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313787
178	NC_014408	AC	3	6	9746	9751	50 %	0 %	0 %	50 %	304313787
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255	NC_014408	T	7	7	15150	15156	0 %	100 %	0 %	0 %	304313793
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259	NC_014408	AAAG	2	8	15553	15560	75 %	0 %	25 %	0 %	304313793
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261	NC_014408	ATT	2	6	15610	15615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304313793
262	NC_014408	TGG	2	6	15634	15639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304313793
263	NC_014408	TA	3	6	15643	15648	50 %	50 %	0 %	0 %	304313793
264	NC_014408	AG	3	6	15654	15659	50 %	0 %	50 %	0 %	304313793
265	NC_014408	AGT	2	6	15872	15877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313794
266	NC_014408	TCCCTT	2	12	15895	15906	0 %	50 %	0 %	50 %	304313794
267	NC_014408	GAT	2	6	16020	16025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313794
268	NC_014408	GAAG	2	8	16055	16062	50 %	0 %	50 %	0 %	304313794
269	NC_014408	TGC	2	6	16071	16076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304313794
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272	NC_014408	TGC	2	6	16295	16300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304313794
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285	NC_014408	GCA	2	6	16787	16792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313795
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372	NC_014408	CTT	2	6	22244	22249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313802
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380	NC_014408	AAT	2	6	22751	22756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304313803
381	NC_014408	TTCA	2	8	22870	22877	25 %	50 %	0 %	25 %	304313804
382	NC_014408	AGC	2	6	23026	23031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304313804
383	NC_014408	TTCC	2	8	23032	23039	0 %	50 %	0 %	50 %	304313804
384	NC_014408	T	6	6	23145	23150	0 %	100 %	0 %	0 %	304313804
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389	NC_014408	CTTC	2	8	23612	23619	0 %	50 %	0 %	50 %	304313804
390	NC_014408	CTC	2	6	23623	23628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313804
391	NC_014408	TCC	2	6	23657	23662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313804
392	NC_014408	TGT	2	6	23716	23721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304313804
393	NC_014408	TCC	2	6	23942	23947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313805
394	NC_014408	CGG	2	6	24018	24023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304313805
395	NC_014408	ACC	2	6	24178	24183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313805
396	NC_014408	GTCT	2	8	24211	24218	0 %	50 %	25 %	25 %	304313805
397	NC_014408	TCC	2	6	24224	24229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313805
398	NC_014408	GGT	2	6	24235	24240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304313805
399	NC_014408	AGGT	2	8	24359	24366	25 %	25 %	50 %	0 %	304313805
400	NC_014408	CCA	2	6	24399	24404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304313805
401	NC_014408	TGT	2	6	24450	24455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304313805
402	NC_014408	CCCT	2	8	24482	24489	0 %	25 %	0 %	75 %	304313805
403	NC_014408	TCG	2	6	24533	24538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304313805
404	NC_014408	CAT	3	9	24603	24611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313805
405	NC_014408	CTT	2	6	24616	24621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313805
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407	NC_014408	TCT	2	6	24726	24731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313805
408	NC_014408	ATGTCA	2	12	24749	24760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304313805
409	NC_014408	TAG	2	6	24767	24772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313805
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412	NC_014408	TCT	2	6	24939	24944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304313806
413	NC_014408	TCC	2	6	24996	25001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304313806
414	NC_014408	TAT	2	6	25024	25029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304313806
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424	NC_014408	GT	3	6	25613	25618	0 %	50 %	50 %	0 %	304313807
425	NC_014408	TCA	2	6	25632	25637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313807
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428	NC_014408	GGC	2	6	25814	25819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304313807
429	NC_014408	GAAACC	2	12	25823	25834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	304313807
430	NC_014408	TGA	2	6	25853	25858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304313807
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432	NC_014408	TCA	2	6	25941	25946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304313807
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